У грі Silent Hill 3 гравець управляє Хізер, простою дівчинкою-підлітком. В один прекрасний день вона відправляється за покупками, але раптово виявляється замкнутою в дивному, страшному місці - страшному містечку Сайлент Хілл. Вона чує кроки; огидні, страшні монстри нападають на неї, і їй доводиться захищатися. Досліджуючи Сайлент Хілл - і своє власне минуле - Хізер повинна знайти спосіб вибратися з страшного міста.
Третя частина серії Silent Hill схожа на свою попередницю візуально і по геймплею. Як і попередні частини, гра представляє собою ужастик на виживання, що поєднує в собі бойові дії (переважно з близької відстані) і рішення головоломок. Гра дещо орієнтована на бойові дії, ніж попередні частини. Хізер вміє ухилятися в бік і блокувати деякі атаки, але в цілому розділяє з іншими героями серії їх відносну невправність в бою.