У Tropico 3 серія повертається до свого коріння, знову граючи в період 1950-2000 років. Будучи скоріше ремейком, ніж справжнім наступником, гра знову дає гравцеві повний контроль над банановою республікою в Карибському басейні. Щоб успішно дожити до кінця свого президентського терміну, Ель Президенте повинен побудувати процвітаючу економіку і зробити так, щоб його жителі були задоволені, а також США і СРСР.
Велика частина міста побудована самим гравцем, включаючи житлові будинки і вулиці. У той час як деякі будівлі потребують простору для виконання своєї роботи (наприклад, ферми), інші потребують з'єднанні з дорогою або не функціонують без електрики. Єдині будівлі, які з'являються автоматично, - це будинки бідних людей. Щоб побудувати своє місто, гравцеві, звичайно ж, потрібні гроші. Гроші заробляються кількома способами. Щороку гравець отримує іноземну допомогу від наддержав. Декілька разів на рік пропливає танкер і відвозить експортні товари, такі як нафта (новий ресурс в Tropico 3) або банани, що також приносить гроші. Ще один спосіб заробити гроші - зробити острів гостинним для туристів і обдирати їх під час відвідування. Найменший дохід гравцеві приносять його власні люди, які платять оренду, користуються доступною розважальною програмою і т.д. Скільки все це коштує, визначає гравець. Він також відповідає за залучення іноземних фахівців, якщо на його острові немає потрібних фахівців, що, з іншого боку, приводить у лють націоналістів на острові. Націоналісти - одна з багатьох груп людей, яких гравець повинен зробити щасливими, крім кожного окремого жителя.
Крім того, кожен громадянин - це окрема особистість, зі своїми іменами, відносинами з іншими громадянами, бажаннями і потребами. Деякі відчувають необхідність досягти успіху в навчанні, інші шукають релігійної освіти, треті просто хочуть добре провести час. Вони навіть приймають політичні пристрасті і працюють в цих цілях. Громадяни не дотримуються сліпих наказів, їх потрібно переконати, задовольнивши їхні бажання, або просто чистою жадібністю або терором, тобто підкупивши їх або уклавши з ними контракт. Останнє особливо корисно, щоб тримати заколотників на відстані, але якщо все не вдається і заколотники нападають, армія гравця і він сам вступають в автоматичну битву, поки не залишиться тільки одна сторона. Гра закінчиться, якщо палац буде підірваний, гравець не буде переобраний або США / СРСР вирішать, що Ель Президентові став скалкою в дупі. Крім того, місії в кампанії містять такі цілі, як відвідування острова 150 туристами.