Майстер підбору гри
27 листопада 2006 року група "морських котиків" ВМС США у складі Кахуни, Бумера, Спектра та Шута відправляється на нейтралізацію терористичної загрози, що виникла. Нова група, що називає себе Залізним братством, складається з колишніх спецназівців, які використовують баржу як базу для купівлі та транспортування зброї. Вони ведуть свої справи з відомою організацією чорного ринку "Земі" і зустрічаються в міжнародних водах біля узбережжя Аляски. Команда має ліквідувати терористів, зібрати розвіддані та викрасти судно. Завдяки зібраним котиками розвідданим, SOCOM вдається виявити штаб-квартиру Братства - місто-привид на Алясці. Перед командою стоїть завдання убезпечити об'єкт, знищити схованки зі зброєю та затримати терориста на ім'я Коля Петренко з позивним Пінкушон. За інформацією, отриманою від "Пінкуша", "Братство" взяло під контроль нафтову платформу в аляскинському морі Бофорта. Більшість нафтовиків загинули, але деякі перебувають у полоні терористів. Братство також погрожує знищити платформу, що призведе до катастрофічного розливу нафти. Морські котики проникають на платформу і нейтралізують усі загрози, включаючи лідера Братства Станіслава з позивним "Спектр". Їм вдається знищити всіх терористів і знешкодити всі бомби на борту.
Гравець очолює команду з чотирьох чоловік (три товариша по команді, керовані штучним інтелектом) "морських котиків" ВМС США, які виконують 12 місій у чотирьох регіонах: Аляска, Таїланд, Конго та Туркменістан у майбутньому 2006 та 2007 роках. В одиночних місіях команди можна віддавати за допомогою USB-гарнітури, що входить до комплекту, або через екранне меню, якщо не була придбана додаткова гарнітура SOCOM. Типові місії полягають у знищенні терористів, порятунку заручників, здобутті розвідувальних даних або знищенні баз терористів.
Кодове ім'я персонажа гравця - Кахуна, а кодові імена напарників по команді - Бумер, Спектр і Блазень. Команда поділяється на дві підгрупи - "Альфа" та "Браво". Група Альфа складається з гравця та Бумера (елемент "Здібності"), а решта двоє складають Браво. Команди можуть віддаватися як окремим гравцям, так і цілій групі, наприклад, можна попросити команду Браво залишатися на місці, поки гравець розвідує місцевість з Бумером. Однак гравець не може наважитися на одиночне проходження карти, коли Кахуна буде занадто далеко від Бумера, він автоматично відновить слідування за гравцем, незалежно від попередніх наказів. Перед кожною місією проводяться брифінги та надаються розвідувальні дані, такі як карти та фотографії.
