Стати частиною анімаційної пригоди Dreamwork, спрямовуючи зебру Марті, лева Алекса, жирафа Мелмана, бегемота Глорію та цих потайливих пінгвінів, коли вони втікають із зоопарку Центрального парку на вулиці Нью-Йорка, а потім у дикі джунглі... ееее... зоопарка Сан -Дієго.
Сюжет такий самий, як і у фільмі, і кожен розділ просуватиме вас далі за сюжетом. У кожному розділі будуть поставлені різні цілі. Для завершення розділу потрібна лише одна конкретна мета, тому ви завжди можете переграти розділ пізніше, щоб спробувати виконати всі цілі.
На кожному етапі вам також доведеться грати за різних персонажів, а на деяких – за всіх.
Кожен персонаж має свої унікальні здібності: Марті може бити задніми лапами, обходити ворогів повзком і робити довгі стрибки. Лев Алекс може кидатися фруктами, використовувати пазурі і гарчати на своїх ворогів. Глорія може перекидатися, підстрибувати та бити ворогів стегном. А коли вона з'їсть трохи перцю чилі, зможе кинутися на ворогів. Мелман може обертатися, кидати предмети та бити ворогів головою. Він також може виконувати рух Вертоліт, який дозволяє йому ковзати на великі відстані. Нарешті, Пінгвін може ковзати, ловити рибу та атакувати фінішним рухом (щось на зразок удару карате), щоб перемогти своїх ворогів.
Протягом усієї гри вам належить збирати різні предмети, у тому числі "Тики життя" для поповнення лічильника здоров'я та гроші мавп, які дозволять вам купити в магазині "Зоовенір" особливі речі, наприклад, міні-ігри та спеціальні вбрання для акторів "Мадагаскару" .