Fear Effect 2: Retro Helix - це приквел до Fear Effect, що описує події, які призводять до початку попередньої гри. Ігровий процес дуже схожий на попередницю, поєднуючи в собі стрілянину, головоломки та екшн. У той час як в першій грі була тільки залежна від персонажа схема управління в стилі жахів виживання, приквел дозволяє гравцеві переключитися на залежне від 3D-камери управління. Гра більш орієнтована на головоломки, ніж перша Fear Effect, і містить більше локацій для дослідження. Додано кілька нових видів зброї та предметів.
Візуальний стиль попередньої гри також присутній у цій частині: гравець переміщується по незатінених 3D-моделях персонажів у стилі аніме на фонах, які складаються з попередньо відрендерених зображень та зациклених або потокових повноцінних відеороликів.