Подібно до сюжету фільму, гра починається на фермі. Ремі вирушає зі своїм братом Емілем, щоб зібрати серцевини яблук для свого батька Джанго. Під час подорожі він навчається основним навичкам, які йому знадобляться, щоб пройти те, з чим йому доведеться зіткнутися пізніше. Після уроку Ремі та Еміль беруть книгу "Шеф-кухар", щоб Ремі міг її почитати. Вони витягують книгу з вікна, яке закривається, що призводить до пробудження старої жінки, яка стріляє по колонії з рушниці. Ремі тікає з книгою, а колонія тікає на саморобних човнах. Врешті-решт, Ремі звертає не туди, куди треба, у каналізацію, і втрачає свою сім'ю.
З книги з'являється фантастичне видіння Ґестеу і каже Ремі, що він може повернути одну зі своїх втрачених зірок після поганої рецензії Антона Его. Ремі погоджується і мандрує вулицями Парижа та потрапляє до ресторану. Однак Ремі падає з вікна і потрапляє в раковину. Ремі намагається втекти, але його увагу привертає смердючий суп, який був забруднений новим сміттярем Лінгвіні. Ремі робить суп набагато кращим і ледь не тікає по кухонній трубі, яка потрапляє назад у каналізацію.
Ремі возз'єднується з Джанго та Емілем і розповідає їм, що вони з іншими щурами збираються вкрасти собачі недоїдки в ресторані. План успішно спрацьовує, але це призводить до того, що Лінгвіні переслідує Ремі, коли бачить, що інші щури йдуть. Лінгвіні врізається в сміттєві баки, і вони домовляються, що Ремі допоможе Лінгвіні на кухні. Потім Ремі спускається по іншій трубі і знову зустрічається зі своїм батьком.