Lego DC Super-Villains - це пригодницька відеогра з видом від третьої особи, в якій чергуються різні дії і сценарії вирішення головоломок.
Як і в попередніх іграх трилогії Lego Batman, таких як Lego Batman 2: DC Super Heroes і Lego Batman 3: Beyond Gotham, гравці отримують доступ до списку знакових персонажів з всесвіту DC, кожен з яких володіє своїми унікальними здібностями. Lego DC Super-Villains відрізняється від інших відеоігор Lego тим, що вперше включає в себе використання власного персонажа, який стає частиною сюжету гри. Спочатку гравці придумують зовнішність, ім'я та вибирають стиль бою, але в міру просування по сюжету отримують доступ до суперздатностей персонажа і відкривають можливості його налаштування.
Сама гра працює на механіці геймплея відеоігор Lego, а також елементів з трилогії Lego Batman Trilogy, фокусуючись на суміші рівнів, що складаються з двох режимів - сюжетного і free roam - разом з елементами відкритого світу між рівнями, з вибором локацій з всесвіту DC, включаючи стислі версії Готем-сіті і Метрополісу, а також Смолвіль, Arkham Asylum, Апоколіпс, сторожову вежу Ліги Справедливості, острів Страйкера, Зал Правосуддя, STAR Labs і Belle Reve; сюжетні рівні включають інші локації, такі як Горила Сіті, Оа, Феміскіра і Нанда Парбат.