Lost Planet 3 - це приквел до оригінальної Lost Planet: Extreme Condition, який продовжує історію Джима Пейтона. Криза енергоспоживання на Землі змусила шукати інші ресурси, і компанія NEVEC запустила експедицію до крижаних замерзлих пусток планети під назвою E.D.N. III, щоб видобути те, що здавалося унікальним типом ресурсу у відомому всесвіті. Джим є частиною цієї експедиції, і хоча йому боляче розлучатися з дружиною та новонародженою дитиною більше ніж на рік за контрактом, він добре оплачується, і він зможе забезпечити свою сім'ю вдома, допомагаючи у видобутку ресурсу, відомого як теплова енергія.
Але робота Джима не обмежується лише видобутком корисних копалин, адже E.D.N. III - зовсім не дружня планета. Коли він не займається видобутком корисних копалин і ремонтом, він заробляє собі на життя, борючись з різними видами Акридів, місцевими формами життя, які заполонили це безплідне місце. Одного разу, старанно виконуючи свої обов'язки, він натрапить на стару занедбану базу NEVEC і в кінцевому підсумку опиниться на межі загибелі під час боротьби з акридами, тільки щоб бути врятованим невідомими мешканцями цієї планети. Чи був НЕВЕК вже на цій планеті? Що сталося з людьми "справжньої" першої експедиції? І чому це трималося в таємниці? І хто врятував йому життя? Питання в голові Джима не дадуть йому спокою, поки він не знайде правду і не приведе сюжет до подій, що відбувалися в оригінальній грі.
Хоча ігровий процес схожий на обидва приквела, він більше орієнтований на сюжет, ніж на місії, що робить його більш схожим на оригінальну гру, ніж на сиквел. Битва з Акридами відбувається так само, як і раніше, ви можете легко позбутися від менших, в той час як битви з босами вимагають, щоб ви почекали, поки вони виявлять свої слабкі місця, які світяться під їх лушпинням. Гра розвивається, коли ви виконуєте основні квести, які рухають історію вперед, але залишають вам багато побічних квестів, які можуть заробити вам різні бонуси.
Теплова енергія є основним ресурсом і, відповідно, валютою, що використовується в грі (на відміну від попередніх двох ігор, де вона використовувалася як здоров'я персонажа). Коли ви перебуваєте на своїй базі, ви можете використовувати зібрані теплові очки для придбання нової зброї або модернізації зброї, наприклад, більші обойми, підсумки для перенесення більшої кількості боєприпасів, вторинні більш руйнівні боєприпаси і т.д. Основним джерелом теплової енергії є те, що Акриди залишають для вас після того, як ви їх вб'єте.