Увібравши в себе кращі риси попередніх ігор серіалу, новий проект поєднує їх з якісно новими елементами геймплея. Другий ігровий персонаж, інтуїтивно зрозуміла система Speed Kill, обстановка і атмосфера стародавнього Вавилона, бої на колісницях і багато, багато іншого. Prince of Persia в черговий раз піднімає планку якості action-ігор.
Повернувшись у Вавилон з імператрицею Каїліна, Принц виявляє царство, розорене війною. Пізніше він дізнається, що Каїліна стала жертвою змови. Смерть імператриці вивільняє Піски Часу, що загрожують зникненням всьому, що дорого спадкоємцеві престолу. Викинутий на вулицю і всіма переслідуваний герой усвідомлює, що їм поступово опановує дух Темного Принца, породжений Пісками Часу.
У боротьбі з самим собою — своїм демонічним двійником — Принцу доведеться відстояти своє право бути правителем Вавилона.