Заснований на новітньому однойменному мультфільмі FOX в стилі аніме, «Черепашки-ніндзя» зображують Леонардо, Рафаеля, Мікеланджело та Донателло у ролі зелених ніндзя. Живучи в каналізації, вони виповзають, коли ніхто не хоче боротися за правду, справедливість і ще один шматочок піци. Борючись із публічним обличчям винахідника Бакстера Стокмана та більш темної фігури Шреддера та його клану Фут, ці черепашки-ніндзя отримають шанс змусити своїх супротивників їсти панцир!
Гра являє собою 3D beat-em-up з кількома гравцями. Усі спрайти гри нагадують мультфільм телешоу, і кожна черепаха має унікальні ходи, звукові байти та стиль бою. Рухи черепашки-ніндзя включають слабкішу/швидшу атаку, сильнішу/повільнішу атаку, ніндзя-сюрикен і стрибки.