Сюжетна лінія розгортається у світі майбутнього, де три фракції борються за природні ресурси. В багатокористувацькому режимі, який є основним у грі, гравці обирають фракцію і б'ються з гравцями з інших фракцій або в командах, або формуючи власну команду з мехів, керованих штучним інтелектом. Мехи можуть бути налаштовані з різною зброєю та навичками, а поведінка ШІ-механізмів також може бути налаштована. Персистентний світ перезавантажується, коли одна фракція домінує над іншими або коли закінчується сезон.
Дія Verdict Day розгортається через 100 років після подій Armored Core V. Забруднення, яке ізолювало людство, почало спадати, дозволяючи людям повернутися в більшу частину світу. Відкриття високотехнологічних веж, колись прихованих забрудненням, розпалило нову "Війну за вирок" між трьома різними фракціями. Три фракції, які зараз контролюють світ, ведуть війну одна проти одної за світове панування і за контроль над таємничими "Вежами", колись прихованими зараженням. До конфлікту додається таємнича група, відома як "Загін Шініґамі", а також використання безпілотних броньованих ядер (UNAC).
Гра розповідає про подвиги неназваного пілота найманського літака напередодні того, що згодом стане відомим як "Війна за вирок". За сприяння найманця Магнолії "Меггі" Кертіс з кодовим ім'ям "Товстун" вони приймають завдання від імені фракцій, перш ніж вступити в конфлікт із загоном "Шініґамі".