Через год после победы над императором Тахионом и похищения Кланка зони в конце игры "Орудия разрушения" Рэтчет и его напарница Талвин Апогей узнают от суперкомпьютера IRIS, что капитан Ангстром Даркуотер, легендарный космический пират, - единственный человек, знающий, как связаться с зони. Отправившись на его родную планету Мердеграу в секторе Дрогол, дуэт проскальзывает на борт пиратского флота над Азорейским морем, но вскоре обнаруживается и попадает в плен к Звездочке, первому помощнику Даркуотера, который сообщает, что Даркуотер мертв уже много лет. За несколько секунд до того, как этих двоих должны были казнить, появляется Расти Пит, переодетый в капитана Ромулуса Слага (которого Рэтчет победил в "Орудиях разрушения"), и приказывает отправить их на остров Хулефар.
После краткого видения Кланка, окруженного светящейся энергией, Рэтчет воссоединяется с Талвином и встречает местного лидера, мэра Барнабаса Уорли. Он поручает Рэтчету восстановить электроснабжение острова, запустив несколько ветряных турбин, а затем направляет его к городскому радисту, который просит Рэтчета купить у контрабандиста Versabolt, чтобы он мог произвести крайне необходимый ремонт. В награду за помощь Уорли раскрывает существование Обсидианового глаза - мощного лоренцианского телескопа, который Даркуотер построил для поддержания связи с родным измерением Зони. К сожалению, источник энергии Ока, артефакт, известный как Звезда Фулкрума, был спрятан Даркуотером незадолго до того, как он погиб во время мятежа, организованного Слэгом.