Оливер остался один после того, как его мать умерла, пытаясь спасти его от утопления. Когда он проливает слезы над куклой, которую она сделала для него, она оживает как Дриппи, лорд-верховный лорд фей. Дриппи показывает, что он пришел из другого мира, где души мира Оливера напрямую связаны с эквивалентными душами. Оливер следует за Дриппи в этот мир в надежде найти двойника своей матери, Великого Мудреца Алисию, у которой может быть ключ к возвращению его матери к жизни, в то время как Дриппи надеется, что Оливер — легендарный волшебник, который спасет его мир от Тьмы. Джинн Шаддар.
Ni no Kuni: Wrath of the White Witch — это ролевая игра, история которой аналогична предыдущей игре, Shikkoku no Madōshi, но с другим поворотом в середине. Игрок управляет Оливером и его Фамильярами, вызываемыми существами, которые разделяют HP и MP Оливера, но чьи другие атрибуты являются его собственными. Враги удивляются внешнему миру и подземельям, и игрок вступает с ними в бой, когда сталкивается с ними. Бой ведется в режиме реального времени, когда игрок отдает команды для атак, которые длятся определенное время. Игрок может переключаться между Оливером и Фамильяром в группе в любое время, но Фамильяры могут оставаться в бою только определенное время, прежде чем их нужно будет вывести из боя.
Во время игры Оливер будет сталкиваться с людьми с избытком или дефицитом определенных качеств личности, таких как энтузиазм. Он должен взять излишек у тех, у кого есть, и отдать его тем, у кого дефицит. Оливер также может выполнять поручения людей, которых он встречает, что дает ему знаки отличия, которые он может обменять на награды.