Dragon Quest Builders 2 - это ролевая игра-песочница, в отличие от типичного для серии Dragon Quest пошагового стиля. Боевая система игры включает два приема: стандартную атаку и "вращающийся кусок". В игре есть возможность находить материалы и использовать их для строительства зданий и другого оборудования. Среди новых возможностей, которых не было в предыдущей игре, - функция быстрого перемещения по карте в ретро-стиле, опциональная перспектива от первого лица, подводное исследование и скольжение.
В отличие от первой Dragon Quest Builders, в игре предусмотрена возможность совместной игры до четырех игроков по сети, а также беспроводная игра на Switch. Игроки также смогут переносить свои игровые данные между совместимыми игровыми консолями и получат за это специальный бонус. Игроки могут посещать миры других игроков даже на других игровых платформах, хотя и не могут изменять их. Они также могут делиться фотографиями, сделанными в режиме внутриигрового фото, и планами строительства, размещая их на кроссплатформенной доске объявлений.
Действие Dragon Quest Builders 2 происходит спустя некоторое время после событий Dragon Quest II и сосредоточено вокруг группы под названием Дети Харгона, которые стремятся отомстить за поражение Харгона и Малрота от потомков Эрдрика, добиваясь того, чтобы все строители были уничтожены и никому не было позволено что-либо создавать. Игроки управляют либо мужчиной, либо женщиной-строителем, известным как Герой, который захвачен этой группой вместе со всеми другими строителями в мире на корабле. Герою удается бежать, и он попадает на остров Пробуждения, где встречает человека по имени Малрот, который ничего не помнит о своем прошлом. Малрот помогает персонажу игрока улучшить свои строительные способности. После посещения нескольких различных островов и помощи их жителям избавиться от убеждений, что созидание и строительство - это зло, выясняется, что мир, в котором они живут, - это иллюзия, созданная Харгоном, чтобы защитить душу поверженного Мастера Разрушения, не кто иной, как Малрот. После ссоры Малрот бросает остальных, и Герой должен отправиться за ним в апокалиптический мир. После столкновения с Харгоном герой должен сразиться с чудовищной истинной формой Малрота, но его человеческая часть сопротивляется и позволяет Герою победить и спасти его. Уничтожив Харгона и чудовищную форму Малрота вместе, Герой и человек Малрот возвращаются к своим друзьям и навсегда сохраняют мир с помощью своих объединенных сил, теперь, когда Малрот научился еще и строить.