Терминатор 2: Судный день включает семь уровней, основанных на конкретных сценах или общих концепциях фильма. Первые четыре уровня действуют как прелюдия, когда игрок обстреливает волны металлических терминаторов через постапокалиптическое поле битвы, осажденное убежище людей и через контрольно-пропускные пункты вражеского суперкомпьютера SkyNet. Уничтожив компьютер, игроки отправляются в прошлое, чтобы защитить Джона и Сару Коннор, а также уничтожить все результаты исследований SkyNet в штаб-квартире его производителя. Оттуда игроки должны отбиваться от несокрушимого Т-1000 до финальной битвы на сталелитейном заводе.
По возможности используются материалы из фильма, такие как голосовые фрагменты Арнольда Шварценеггера и крупные цифровые кадры Роберта Патрика для финальной битвы против Т-1000. Версии Genesis и SNES также поддерживают легкое оружие (Menacer и Super Scope соответственно).