Borderlands: Pre-Sequel! - это третья основная игра в серии шутеров от первого лица. Как и в предыдущих играх, он предлагает различные среды с процедурным контентом и свободным исследованием. Выполняя квесты, вы зарабатываете опыт, чтобы распределять очки навыков и строить персонажа с помощью деревьев навыков с элементами ролевых игр. Добыча и особенно много различных типов оружия играют важную роль в дополнении пути персонажа.
Сюжет разворачивается между первой и второй играми, а точнее между двумя предметами DLC: The Secret Armory of General Knoxx и New Robot Revolution от Claptrap. В нем рассказывается, как к власти пришел красавчик Джек, главный антагонист Borderlands 2. Афина рассказывает об этом как о воспоминаниях Афины после событий Borderlands 2, когда она схвачена и допрошена Лилит. Она объединилась с тремя охотниками за убежищами, чтобы направиться к лунной базе Гиперион Гелиос, но по пути они попадают в засаду и совершают аварийную посадку на лунную базу. Большая часть игры происходит сначала на спутнике Пандоры Эльпис, а затем на Гелиосе.