Red Faction: Guerrilla - это третья часть серии Red Faction, которая отходит от жанра шутера от первого лица, как в предыдущих двух частях, и представляет собой песочницу с открытым миром, похожую на Mercenaries, Grand Theft Auto или Saints Row (разработкой которых также занималась компания Volition).
События игры разворачиваются спустя 50 лет после событий первых двух игр. Марс был освобожден от коварной корпорации Ultor силами Red Faction, а E.D.F. (Силы обороны Земли) вступили в игру, чтобы помочь шахтерскому сообществу встать на ноги. Однако E.D.F. стали оккупационными силами, захватив планету, казнив граждан и введя на ней военное положение. В результате был сформирован новый элемент Red Faction, чтобы бороться с E.D.F. и снова принести мир и свободу на марсианский ландшафт. Игрок берет под свой контроль Алека Мейсона, недавно прибывшего с Земли диссидента, который надеется начать новую жизнь на Марсе вместе со своим братом Дэном, но ему предстоит принять участие в революции и освободить пять секторов Марса (Паркер, Пустоши, Оазис, Свободную Огненную Зону и Эос) от контроля E.D.F.. Для этого игрок должен выполнять задания и уничтожать транспортные средства и имущество E.D.F., ослабляя их контроль над каждым сектором и поднимая моральный дух жителей.
Миссии варьируются от сюжетных миссий, целью которых является дальнейшее развитие сюжета, до других миссий, включая Transporter (возвращение определенных транспортных средств в безопасное место за определенное время), Guerrilla Raid (где игрок и группа повстанцев нападают на здание E.D.F. и уничтожают его). (где игрок с группой повстанцев атакует здание и разрушает его), Heavy Metal (где игрок обеспечивает отвлекающий маневр, позволяющий повстанцам выполнить другое задание, не тревожа E.D.F.), Demolition Master (где игрок должен уничтожить цель за определенное время и с ограниченным запасом патронов) и House Arrest (где игрок должен спасти заложников и вернуть их в безопасное место).