В декабре 1998 года, через три месяца после побега из Раккун-Сити (показанного в Resident Evil 2) перед его окончательным уничтожением (показанным в Resident Evil 3: Nemesis), Клэр Редфилд совершает налет на объект корпорации Umbrella в Париже в поисках своего брата Криса Редфилда. Обнаруженная силами безопасности "Амбрелла" и в итоге захваченная, Клэр оказывается в тюрьме на острове Рокфорт, тюремном комплексе, принадлежащем корпорации и расположенном в Южном океане. Через некоторое время после заключения Клэр оказывается освобожденной человеком, который ее захватил, и обнаруживает, что произошла вспышка Т-вируса. В образовавшемся хаосе она объединяется со Стивом Бернсайдом, другим заключенным, пытающимся сбежать.
В игре Resident Evil - Code: Veronica имеет геймплей в стиле survival horror, похожий на предыдущие игры серии Resident Evil. В игре присутствует фирменное управление, интерфейс, головоломки, а также зомби и монстры, с которыми предстоит сражаться. В отличие от предыдущих игр серии, в которых использовались предварительно отрендеренные фоны, в Code: Veronica использует 3D-окружение в реальном времени. Благодаря этому камера более динамична, чем в предыдущих играх. Камера следует за игроком, панорамирует и масштабирует его, когда он перемещает своего персонажа по окружающей среде, подобно игре Dino Crisis (1999) от Capcom. История рассказывается через кинематографические CGI-последовательности и внутриигровые сцены.