Действие Star Trek Legacy начинается через несколько лет после окончания телесериала Star Trek Enterprise. Звездный флот быстро развивается, появились новые технологии, такие как тяговый луч или звездные базы. Вы садитесь за штурвал звездолета "Энтерпрайз NX-01", который был сильно модернизирован и оснащен всеми передовыми технологиями, и ваша миссия - найти пропавший вулканский корабль. Во время кампании у вас будет возможность поиграть всеми великими кораблями из пяти серий, вплоть до USS Voyager под командованием капитана Джейнвей. Все пять капитанов (Арчер, Кирк, Пикард, Сиско, Джейнвей) озвучены своими актерами из телесериалов.
Личный корабль
Вы управляете своим кораблем либо непосредственно с помощью контроллера, либо отдавая приказы своему штурвалу на карте текущего сектора или отмечая планеты или врагов прямо на экране. В зависимости от того, насколько хорошо вы справились с миссией, вы зарабатываете командные очки, на которые можно купить до 4 кораблей. Они действуют как отряд. Вы можете отдавать им отдельные команды, например, защищать эту позицию, или взять на себя командование и сказать им делать то, что делаете вы. Если вас не устраивают действия отдельных кораблей, вы можете в любой момент взять штурвал на себя.
мультиплеер
Во время кампании вы управляете только кораблями Объединенной федерации планет и сражаетесь с клингонами, ромуланцами и боргами. Но в мультиплеере вы можете принять любую сторону и сражаться против 4 других игроков или вместе против общей угрозы в коопе, в котором каждый игрок берет под контроль один корабль отряда.
Разнообразие миссий
Также в игре много сражений с вражескими кораблями, ваши цели миссии включают сопровождение медицинских кораблей на отравленные планеты или защиту планет от приближающихся астероидов.