Ratchet and Clank: Into the Nexus - шутер от третьего лица с элементами головоломки. Короче, чем предыдущие названия серии, она задумана как эпилог к подсерии «Future» (Tools of Destruction, Quest for Booty и A Crack in Time). Также игру можно использовать вместе с Before the Nexus.
После побега из тюрьмы печально известного преступника по имени Вендра Прог, которому помог ее брат-близнец Нефтин, Рэтчет и Кланк обнаруживают, что Близнецы создали свой собственный Dimensionator. Поступая так, Близнецы перенесли существ через портал под названием Пустоты, которым управляет лидер по имени Мистер Око.
В игре игрок в основном управляет Рэтчетом, используя множество оружия и гаджетов, знакомых по серии, но также и некоторые более новые. Рэтчету помогает в его движении Кланк, использующий Heli Pack, чтобы продвигаться вперед или безопасно парить на земле. Позже его можно будет модернизировать до Jetpack.
В некоторых частях игры игрок берет на себя управление Кланком в путешествиях в стиле бокового скроллера по Вселенной Пустоты. В этих разделах Кланк должен управлять гравитацией и решать головоломки, чтобы вернуть Нижний мир к порталу, чтобы вызвать «землетрясение» и разрушить барьер, блокирующий путь дуэту.
Уровень Рэтчета повышается по мере того, как он побеждает врагов и получает больше очков здоровья. Оружие можно улучшить как при обычном использовании (автоматический сбор наномитов с павших врагов), так и при использовании раритана (редкий минерал, обнаруженный во вселенной). Модернизируемые доспехи (покупаемые у продавцов), очки навыков, читы и золотые болты вернулись из предыдущих игр.