Две могущественные империи, Архадия и Розария, находятся в состоянии войны. Все, что их волнует, - это победа над соперником. Чтобы достичь ее быстрее, Архадия вторгается в маленькое королевство Далмаска. Молодой принц Далмаски падает в бою вскоре после свадьбы с прекрасной принцессой Аше. Король убит при загадочных обстоятельствах незадолго до подписания мирного договора с Архадией. В маленькой стране устанавливается железная власть империи.
Игрок берет под свой контроль молодого вора по имени Ваан, который живет в Рабанастре, столице Далмаски. В результате ряда событий Ваан оказывается вовлеченным в политическую борьбу, надеясь отомстить за смерть своего вероломно убитого брата.
Действие Final Fantasy XII происходит в Ивалисе, фэнтезийном мире, который также послужил местом действия для Final Fantasy Tactics. Игра отличается от своих предшественников несколькими основными аспектами геймплея. Игровой мир состоит из огромных территорий с заметно ходящими врагами. В игре нет отдельных экранов для боя; бой происходит в том же окружении, что и исследование. Персонажи, управляемые игроком, могут свободно перемещаться во время боя. Действия по-прежнему выбираются путем выбора команд из всплывающего меню, и у каждого персонажа есть традиционная полоса ATB, которая определяет, когда он или она может действовать; однако в целом бой напоминает систему "реального времени с паузой" западных ролевых игр, таких как Knights of the Old Republic.
Игрок может отдавать определенные команды членам партии или назначать им стратегии боя (в игре они называются "гамбитами"). Новая магия, способности и снаряжение покупаются в магазинах или находятся в контейнерах в мире. Прежде чем персонаж сможет использовать любую из них, игрок должен купить соответствующую лицензию, потратив очки лицензии, заработанные в бою. Они действуют как очки навыков и могут быть распределены игроком вручную на доске лицензий персонажа.
В дополнение к врагам и боссам, которых можно найти, следуя сюжету, игрок также может принимать "Охоты", вывешенные в барах или предлагаемые игроку в разговорах. Это необязательные встречи, в которых игрок должен выследить и заманить в ловушку или приманить очень сильного монстра, прежде чем победить его.