Red Faction: Armageddon происходит через 50 лет после событий Red Faction: Guerrilla и также происходит на Марсе. Игрок берет на себя роль Дариуса Мейсона, благонамеренного парня, который хочет только лучшего для своего народа. К сожалению, не только по его вине террорист может уничтожить машину, которая создает на планете благоприятную для человека атмосферу, из-за чего людям приходится укрыться под землей, но и по ошибке выпустить враждебную инопланетную расу. Поскольку выжившие люди не слишком довольны его достижениями, настало время выйти в туннели и все исправить!
Большим отличием от своего предшественника является отсутствие открытого мира; Armageddon - это линейный шутер от третьего лица. Большая часть игры - это именно это: прохождение уровней и убийство инопланетных масс или человеческих культистов с помощью смеси обычного и научно-фантастического оружия. Иногда встречаются битвы с боссами и эпизоды с транспортными средствами, например, внутри мехов. На уровнях можно найти ценные предметы, которые можно обменять на улучшение персонажа или оружия. От предшественников в игре осталась разрушаемая местность, которую также можно использовать для уничтожения врагов. Конечно, это означает, что Дариус может разрушить свой путь к выходу - но, к счастью, у него есть удобное устройство, которое позволяет ему восстанавливать окружение.
Помимо кампании есть два дополнительных игровых режима. Смысл режима разрушения заключается в том, чтобы набрать как можно больше очков за ограниченный промежуток времени. Очки зарабатываются путем разрушения окружающей среды. Второй режим, рассчитанный на кооперативную игру до четырех игроков, состоит в основном из борьбы с вражескими волнами.